Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP9Q7RTR0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.3 ms