Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SND1Q7KZF4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.351e-7■■■■□ 21.1
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SND1Q7KZF4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.125e-7■■■■□ 21
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SND1Q7KZF4 ZNRD1-206ENST00000471008 3672 ntTSL 1 (best)11.81□□□□□ -0.525e-7■■■■□ 21
SND1Q7KZF4 ZNRD1-202ENST00000359374 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.565e-7■■■■□ 21
SND1Q7KZF4 ZNRD1-205ENST00000463141 571 ntTSL 211.14□□□□□ -0.635e-7■■■■□ 21
SND1Q7KZF4 MFGE8-206ENST00000558029 849 ntTSL 318■□□□□ 0.473e-10■■■■□ 21
SND1Q7KZF4 INSIG1-205ENST00000468307 852 ntTSL 57.51□□□□□ -1.212e-8■■■■□ 21
SND1Q7KZF4 SARAF-211ENST00000522794 808 ntTSL 58.06□□□□□ -1.121e-7■■■■□ 21
SND1Q7KZF4 HSD17B2-201ENST00000199936 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.791e-6■■■■□ 21
SND1Q7KZF4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-8■■■■□ 20.9
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