Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM5Q71RC9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms