Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf139Q6ZV77 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms