Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms