Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms