Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms