Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW49

SPESP1, Sperm equatorial segment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPESP1Q6UW49 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPESP1Q6UW49 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPESP1Q6UW49 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms