Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms