Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms