Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LARP1Q6PKG0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms