Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP4Q6PIL6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms