Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAVIN1Q6NZI2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms