Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms