Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms