Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms