Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms