Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms