Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms