Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms