Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms