Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms