Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms