Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms