Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q5VSD8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q5VSD8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q5VSD8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q5VSD8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q5VSD8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q5VSD8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q5VSD8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q5VSD8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q5VSD8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q5VSD8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q5VSD8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms