Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms