Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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