Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN11Q5T124 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms