Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
FRMPD1Q5SYB0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms