Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC158Q5M9N0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC158Q5M9N0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC158Q5M9N0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC158Q5M9N0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC158Q5M9N0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC158Q5M9N0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC158Q5M9N0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC158Q5M9N0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC158Q5M9N0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms