Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPM1JQ5JR12 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPM1JQ5JR12 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms