Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms