Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAVIN4Q5BKX8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms