Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCAF6Q58WW2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF6Q58WW2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms