Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms