Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL12Q53G59 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms