Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAN2Q504Q3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAN2Q504Q3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAN2Q504Q3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAN2Q504Q3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN2Q504Q3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAN2Q504Q3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms