Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1LQ4VXU2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms