Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A4Q4VNC1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms