Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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