Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM30BQ3MIR4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms