Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD55Q3KP44 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms