Protein–RNA interactions for Protein: Q3E827

LSO1, Protein LSO1, yeastyeast

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSO1Q3E827 NRD1YNL251C 1728 nt5.54□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 UTR4YEL038W 684 nt5.54□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 THO1YER063W 657 nt5.54□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 YER076CYER076C 909 nt5.54□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.54□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 RPE1YJL121C 717 nt5.54□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 PGU1YJR153W 1086 nt5.54□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 LDB18YLL049W 540 nt5.54□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 MRPL51YPR100W 423 nt5.54□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 NTH1YDR001C 2256 nt5.54□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 ARN2YHL047C 1863 nt5.54□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 GEM1YAL048C 1989 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 PHO13YDL236W 939 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 YDR199WYDR199W 366 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 GLC7YER133W 939 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 LYS5YGL154C 819 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 CAX4YGR036C 720 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 YIP1YGR172C 747 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 MRPS16YPL013C 366 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 KKQ8YKL168C 2175 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 YKL075CYKL075C 1353 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 YTP1YNL237W 1380 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 TOS3YGL179C 1683 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 CDC5YMR001C 2118 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 RTS1YOR014W 2274 nt5.53□□□□□ -1.52
LSO1Q3E827 APP1YNL094W 1764 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 CUE3YGL110C 1875 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 snR9snR9 187 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YDR114CYDR114C 303 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YER084WYER084W 387 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 FMP33YJL161W 543 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YJR011CYJR011C 786 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 POM33YLL023C 840 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 IRC19YLL033W 693 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YNL109WYNL109W 546 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 CAF20YOR276W 486 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 ADF1YCL058W-A 342 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 SEG2YKL105C 3399 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 NOP12YOL041C 1380 nt5.52□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YTA6YPL074W 2265 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 ZUO1YGR285C 1302 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 ADE6YGR061C 4077 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 CHK1YBR274W 1584 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 AFT1YGL071W 2073 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 snR5snR5 204 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 SUR2YDR297W 1050 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YEL068CYEL068C 333 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YOS1YER074W-A 258 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 LRP1YHR081W 555 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 POR2YIL114C 846 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 SNX4YJL036W 1272 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YLR400WYLR400W 474 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 MRPL44YMR225C 297 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 RCL1YOL010W 1104 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 INA17YPL099C 549 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 CUR1YPR158W 759 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 KAR4YCL055W 1008 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 FRS2YFL022C 1512 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 TDA11YHR159W 1515 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 JJJ1YNL227C 1773 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 RVB1YDR190C 1392 nt5.51□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 AI4Q0065 1671 nt5.5□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YOR365CYOR365C 2112 nt5.5□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 SRP1YNL189W 1629 nt5.5□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 SDH4YDR178W 546 nt5.5□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YHR213WYHR213W 597 nt5.5□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 ERP1YAR002C-A 660 nt5.5□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YAR062WYAR062W 597 nt5.5□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YNL058CYNL058C 951 nt5.5□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 MRP21YBL090W 534 nt5.5□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YOL150CYOL150C 312 nt5.5□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 ECM23YPL021W 564 nt5.5□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 LTV1YKL143W 1392 nt5.5□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 RAD30YDR419W 1899 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 SAC1YKL212W 1872 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 PMT4YJR143C 2289 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 FIN1YDR130C 876 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 MSW1YDR268W 1140 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 AGA2YGL032C 264 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YGR018CYGR018C 330 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 SLX9YGR081C 633 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YKL063CYKL063C 504 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YMR122CYMR122C 375 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YBL055CYBL055C 1257 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 RBL2YOR265W 321 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YBR090CYBR090C 369 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 ASM4YDL088C 1587 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 MRH4YGL064C 1686 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 MNS1YJR131W 1650 nt5.49□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 SER33YIL074C 1410 nt5.48□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 RAD28YDR030C 1521 nt5.48□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 ALG2YGL065C 1512 nt5.48□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 TYW1YPL207W 2433 nt5.48□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YDR187CYDR187C 519 nt5.48□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 RPL17AYKL180W 555 nt5.48□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YPT7YML001W 627 nt5.48□□□□□ -1.53
LSO1Q3E827 YML053CYML053C 639 nt5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms