Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VMACQ2NL98 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VMACQ2NL98 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms