Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q1T7F1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q1T7F1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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