Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187BQ17R55 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM187BQ17R55 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM187BQ17R55 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM187BQ17R55 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM187BQ17R55 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms