Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXNRD1Q16881 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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TXNRD1Q16881 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
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TXNRD1Q16881 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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TXNRD1Q16881 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
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TXNRD1Q16881 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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TXNRD1Q16881 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TXNRD1Q16881 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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TXNRD1Q16881 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
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TXNRD1Q16881 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
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TXNRD1Q16881 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TXNRD1Q16881 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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