Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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CTF1Q16619 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTF1Q16619 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTF1Q16619 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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