Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCBQ16585 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCBQ16585 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms