Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SNAPC1Q16533 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SNAPC1Q16533 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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SNAPC1Q16533 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
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SNAPC1Q16533 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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